Le Centre de protéomique du cancer Segal (SCPC) est une installation de pointe bien équipée en protéomique et en métabolomique dont le fonctionnement est soutenu par Génome Canada et la Fondation canadienne pour l'innovation. Le SCPC est situé au sein de l'Institut Lady Davis de l'Hôpital général juif de Montréal. Il est dirigé par le Dr Christoph Borchers, professeur titulaire au département d'oncologie Gerald Bronfman de l'Université McGill et figure de proue dans le domaine de la spectrométrie de masse des protéines.
À propos de nous
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Christoph Borchers, PhD
Directeur
Le Dr Borchers est professeur au Département d'oncologie Gerald Bronfman de l'Institut Lady Davis de l'Hôpital général juif de l'Université McGill et titulaire de la Chaire Segal McGill en oncologie moléculaire. Il est devenu Fellow de l'Académie canadienne des sciences de la santé en 2013 et le Life Sciences BC Award/Genome BC Award for Scientific Excellence en 2016. Ses recherches englobent la protéomique structurale et quantitative ainsi que la métabolomique quantitative, avec un accent clair sur les applications cliniques et traduction. Le laboratoire du Dr Borchers a développé des tests de spectrométrie de masse ciblés pour la quantification « absolue » de milliers de protéines provenant de cellules, de tissus et de biofluides, y compris des membres de la voie PI3K/AKT/mTOR et de l'axe de signalisation PD-L1. Il a en outre développé des tests MS pour déterminer les taux de mutation des facteurs de cancer connus dans les tissus tumoraux au niveau des protéines et pour déterminer la concentration d'immunothérapies dans le sang des patients, pour le suivi thérapeutique des médicaments. Les tests MS ciblés développés dans le laboratoire Borchers sont utilisés à la fois pour la recherche fondamentale et pour compléter les tests génomiques existants en oncologie de précision. Le Dr Borchers a plus de 325 publications en protéomique basée sur la spectrométrie de masse, avec un indice H de 77 et plus de 25 000 citations.
Evgeny Petrotchenko, MD, PhD
Directeur associé
(Protéomique structurale, SEP clinique, Métabolomique). Il a obtenu son doctorat en médecine du deuxième institut médical de Moscou, à Moscou, en Russie, et son doctorat. en chimie bioorganique de l'Institut de chimie bioorganique de l'Académie nationale des sciences du Bélarus, Minsk, Biélorussie. Il a mené des études postdoctorales à l'Institut national des sciences de la santé environnementale, aux Instituts nationaux de la santé de Research Triangle Park, Caroline du Nord et à l'Université de Caroline du Nord à Chapel Hill, Caroline du Nord. Il a été professeur adjoint de recherche à l'Université de Victoria-Genome BC Proteomics Centre, Université de Victoria, Colombie-Britannique, Canada. Ses recherches portent sur le développement et l'application des approches de protéomique structurale pour l'étude de la structure des protéines dans des pathologies telles que les maladies neurodégénératives liées au mauvais repliement des protéines. Depuis peu, il est impliqué dans le développement et l'application des méthodes analytiques MS dans les cliniques et le développement des analyses métabolomiques.
Yassen Mohammed, PhD
Yassene est professeur adjoint au Centre de protéomique et de métabolomique du Centre médical universitaire de Leiden, aux Pays-Bas. Il est également responsable de la bioinformatique au Centre de protéomique de l'Université de Victoria, au Canada, où il est également professeur adjoint adjoint à la Division des sciences médicales. Il a obtenu son doctorat à l'Université de Göttingen, en Allemagne. Une grande partie des activités récentes de Yassene se concentre sur la protéomique ciblée quantitative et ses applications cliniques. Il est co-auteur de plusieurs ouvrages sur les méthodes et les applications de quantification précise des protéines du plasma sanguin à l'aide de la spectrométrie de masse et d'étalons internes de peptides de substitution fortement marqués. Il est également actif dans l'exploration de nouvelles approches pour l'analyse des données de spectrométrie de masse, l'intégration -omique, ainsi que l'automatisation de l'extraction d'informations à partir de ces données.
Directeur associé
Adriano Pimenta, PhD
Coordonnateur administratif principal
Adriano est le coordonnateur administratif principal de SCPC. Il a été professeur agrégé à l'Université fédérale de Minas Gerais (UFMG), au Brésil, pendant 18 ans avant de déménager au Canada en 2022 et de rejoindre le SCPC le 22/11. Diplômé en sciences biologiques (baccalauréat en zoologie) et Ph.D. en Sciences Biologiques (Physiologie et Pharmacologie) de l'UFMG. Adriano a également été chercheur postdoctoral à l'Université de la Méditerranée (Marseille, France; 1999/2001) et professeur invité à l'Université de l'Alberta (2013-2014). Il possède une solide expérience dans la direction de projets de recherche de découverte de médicaments à orientation structurelle ou fonctionnelle, combinant des approches de biochimie, de pharmacologie moléculaire, de biologie cellulaire et de protéomique. Adriano est responsable de la supervision et de la gestion des opérations, des budgets et des activités de recherche en protéomique et de son personnel au SCPC.
Ute Borchers
Technicien administratif
Ute a rejoint le Segal Cancer Proteomics Center en 2019. Elle a obtenu son baccalauréat en chimie de la Natural Science-Technical Academy, Isny, Allemagne.
Géorgie Mitsa
Étudiant diplomé
Georgia Mitsa est candidate au doctorat au Département de médecine expérimentale de l'Université McGill à Montréal, Canada. Ses recherches combinent la protéomique, la métabolomique et la génomique pour obtenir des informations mécanistes sur les tumeurs malignes difficiles à traiter. La Géorgie vise à faire progresser la traduction des multi-omiques dans la clinique pour générer une image phénotypique complète des changements moléculaires oncogènes. L'objectif ultime est de permettre une prise de décision clinique rapide et fiable en utilisant l'analyse multi-omique des biopsies cliniques. À cette fin, la Géorgie a développé plusieurs méthodes quantitatives basées sur la spectrométrie de masse pour la caractérisation moléculaire multi-omique d'échantillons cliniques biobanqués. Elle dirige actuellement une étude à grande échelle pour étudier les changements moléculaires dans les cancers colorectaux métastatiques qui sont réfractaires au traitement standard. Elle a en outre initié et conduit une étude à grande échelle ciblant les changements protéomiques dans le carcinome canalaire du sein pré-invasif ; ce projet applique sa méthode récemment publiée pour la protéomique quantitative basée sur la spectrométrie de masse à partir de biopsies à l'aiguille centrale incluses dans du formol et de la paraffine.
Connie Sobsey
Étudiant diplomé
Connie est une candidate au doctorat qui a rejoint le SCPC en 2017. Elle est supervisée par le Dr Gerald Batist. Son projet consiste à valider et à appliquer des technologies de protéomique quantitative dans des échantillons de tissus cancéreux afin de mieux prédire les réponses individuelles des patients aux traitements ciblés.
Vincent Lacasse
Étudiant diplomé
Vincent est un doctorant qui a rejoint le SCPC en 2019. Il est co-supervisé par le Dr Alen Spatz, et il travaille sur des tests immuno-MS pour étudier la signalisation PD-L1 afin de mieux prédire la réponse des tumeurs individuelles au point de contrôle immunitaire. inhibiteurs.
Neda Booshehri
Étudiant diplomé
Neda est une étudiante diplômée qui a rejoint le SCPC en 2022. Elle est co-supervisée par le Dr Allen Spatz, et elle travaille sur des tests immuno-Ms pour étudier la signalisation PD-L1.
ForoughSadate Absar
Étudiant diplomé
Forough est une étudiante diplômée qui a rejoint le SCPC en 2022. Elle a obtenu un diplôme en médecine de l'Université des sciences médicales de Beheshti (SBMU) et elle travaille sur la protéomique structurale.
Constantinos Blidjios
Étudiant diplomé
Costa est un étudiant diplômé qui a rejoint le SCPC en 2022 et il travaille sur les approches bioinformatiques de la recherche sur le cancer.
Étudiant diplomé
Negarsadat Mostoolizade
Negarsadat Mostolizadeh est titulaire d'une maîtrise. étudiante à l'Université McGill et est devenue membre du SCPC en 2022. Elle est co-supervisée par le Dr Mark Basik. Son projet de recherche actuel implique l'utilisation du test MRM pour quantifier l'expression de Her2 dans les tumeurs Her2-low. Le but de ce travail est de faire la distinction entre les cas HER2-bas et HER2-négatifs et de fournir de meilleures informations pour la prise de décision thérapeutique pour les patients atteints de cancer.
Neginsadat Mostoolizade
Étudiant diplomé
Neginsadat Mostolizadeh est titulaire d'une maîtrise. étudiant à l'Université McGill et membre du SCPC. Elle a rejoint l'équipe en 2022 et est co-supervisée par le Dr Gerald Batist. Son projet de thèse de maîtrise porte sur le test et l'optimisation des performances d'un profil protéomique associé à la réponse du Capivasertib dans les lignées cellulaires cancéreuses et les échantillons de tumeurs de patients. Son objectif ultime est de rendre les données de profil protéomique utiles en milieu clinique.
Étudiants diplômés
Étudiants diplômés
Research Associates/ Managers/ Directors
Dominik Domanski
André Leblanc, Facility Manager, 2016-2018
René P. Zahedi, Associate Director, 2018-2022
Graduate Students/ Post-Doctoral Fellows
Vanessa P. Gaspar, Post-Doc (2018-2021), Experimental Medicine, McGill University, Montreal, QC, Canada
Sahar Ibrahim, PhD (2016-2022), Experimental Medicine, McGill University, Montreal, QC, Canada
Visiting students (more than 5 months)
Margherita Dell’Aica , PhD (2018), Leibniz-Institute of Analytical Sciences, ISAS e.V., Dortmund, Germany
Tamara Scheidt, PhD (2019), Department of Biosciences, University of Salzburg, Austria