Identification des protéines, modifications post-traductionnelles (PTM)

Nous utilisons la spectrométrie de masse des protéines à haute résolution pour identifier les protéines, leurs séquences primaires et les PTM (par exemple, phosphorylation, Lys-acétylation, ubiquitination, clivage protéolytique, glycosylation) à partir d'un large éventail d'échantillons, des protéines purifiées et des complexes protéiques au gel bandes, IP, expériences BioID, organites, cellules, tissus (frais-congelés et FFPE) et biofluides.

Quantification sans étiquette (LFQ), étiquettes isobares (TMT, iTRAQ), MS ciblées (MRM, PRM)

Nous utilisons une gamme de technologies pour la quantification relative (découverte) et absolue (validation) des protéines et des PTM dans des échantillons biologiques, allant d'aussi peu que 3 échantillons par condition à des centaines d'échantillons. Des flux de travail expérimentaux et informatiques robustes nous permettent d'identifier les protéines candidates et les PTM qui sont régulés de manière significative entre les échantillons.

Nos tests MS ciblés permettent la quantification précise et multiplexée des concentrations de protéines de centaines de protéines grâce à l'utilisation de peptides standard marqués par des isotopes stables (SIS) comme étalons internes.

Essais cliniques pour les protéines, les métabolites et les médicaments, surveillance thérapeutique des médicaments (TDM)

Nous développons des tests d'intérêt médical basés sur la spectrométrie de masse et les mettons en œuvre dans un cadre clinique.  Les applications comprennent les analyses de métabolites et de protéines à valeur diagnostique, ainsi que la surveillance des médicaments.  Nous appliquons également les approches protéomiques et métabolomiques à l'usage clinique, comme les tests robustes pour la quantification précise des protéines cancéreuses dans les tissus tumoraux (FFPE et frais congelés) avec une très grande sensibilité.